Компьютер научили распознавать одиночные раковые клетки

UA.TODAY, 2017-10-13 02:15
Компьютер научили распознавать одиночные раковые клетки

Новый алгоритм SCENIC реконструирует генную регуляторную сеть и распознает состояние одиночной клетки.

Благодаря этому алгоритму, врачи смогут распознавать отдельные типы раковых клеток.

Последние достижения в области одноклеточного секвенирования уже позволили измерить, какие из наших 20000 генов активны в отдельной клетке. Эти методы обеспечивают беспрецедентный уровень детализации. Но, когда этот метод применяется к тысячам клеток из различных тканей, задача становится очень сложной, поскольку необходимо обработать огромные объемы данных.

"Мы разработали SCENIC, компьютерную программу, которая идентифицирует различные типы клеток, на основе экспрессии генов, быстро и точно. Это позволяет лучше понять, как регулируется судьба типов клеток, а также позволяет идентифицировать основные регуляторы, которые могут быть потенциальными целями лекарств", - пояснил биолог Стен Аэртс, один из авторов алгоритма.

После применения программы оказалось, что кластерный анализ по типу клетки оказался для SCENIC точнее, чем у многих специализированных методов кластеризации отдельных клеток.

"Этот новый метод не только поможет нам узнать больше о различных клетках в нашем теле. Это также позволит нам узнать о том, как активность клеток меняется в течение времени, или когда мы заболеваем", - объяснила один из авторов исследования, Сара Айбар Сантос.

Команда уже применила этот метод к ткани мозга мышей и человека. Они также использовали его для анализа и сравнения раковых клеток головного мозга и опухолей кожи, что привело к выявлению новых типов клеток, связанных с метастазами, а также позволило лучше понять механизм распространения раковых клеток в другие части тела.

Новости по теме:
Источник: ua.today
Просмотров: 14

Новости партнеров:
наука компьютеры
Если Вы заметили ошибку, пожалуйста, выделите некорректный текст и нажмите Ctrl+Enter - так Вы поможете нам улучшить сайт. Спасибо!
Оцените важность новости от UA TODAY
0.00 из 10 на основе 0 оценок.
Отправить Закрыть